Arrivé au FC Nantes à l'été 2018, Fabio a prolongé son contrat avec le FC Nantes d'une année supplémentaire. Le brésilien est désormais lié au club jusqu'en 2021. Depuis son arrivée il y a deux ans et demi, Fabio a porté le maillot du FC Nantes à 48 reprises, et délivré 2 passes décisives.